W 1866 roku na oceanach pojawia się tajemniczy obiekt, przewyższający prędkością i rozmiarem największe morskie stworzenia, który sieje zniszczenie wśród statków. Naukowcy i prasa spekulują, że to nieznany gatunek gigantycznego narwala. W odpowiedzi na zagrożenie, amerykańska fregata "Abraham Lincoln" wyrusza na ekspedycję myśliwską, wioząc na pokładzie profesora Aronnaxa, jego służącego Consela i harpunnika Neda Landa. Po starciu z domniemanym potworem, bohaterowie trafiają do wody, by zostać uratowani i jednocześnie uwięzieni na pokładzie zaawansowanego okrętu podwodnego „Nautilus”, dowodzonego przez enigmatycznego kapitana Nemo. Nemo, który zerwał wszelkie więzi z ludzkością i zbudował swój podwodny świat, zmusza ich do pozostania na „Nautilusie”, aby zachować jego tajemnicę. Rozpoczyna się ich niezwykła podróż przez niedostępne głębiny oceanów, pełna zdumiewających odkryć, ale i nieustannych pragnień ucieczki.