В 1866 году таинственный подводный объект, по скорости и размерам превосходящий кита, начинает появляться в океанах, вызывая панику и повреждая корабли. Ученые и общественность озадачены, предполагая, что это неизвестное морское чудовище. Для его уничтожения отправляется американская экспедиция на фрегате "Авраам Линкольн", в составе которой находятся профессор Аронакс, его слуга Консель и гарпунёр Нед Ленд. Однако после столкновения с "чудовищем" герои оказываются в воде и попадают на борт невероятной подводной лодки "Наутилус", которой командует загадочный капитан Немо. Немо, разорвавший все связи с миром, объявляет, что герои теперь пленники и будут путешествовать с ним в глубинах океана, чтобы сохранить тайну его судна. Так начинается их захватывающее и вынужденное путешествие по неисследованным морским просторам, полное удивительных открытий и постоянных попыток к бегству.