В 1866 году моряков по всему миру тревожит появление загадочного морского объекта, превосходящего китов по скорости и размерам. После многочисленных столкновений, наносящих ущерб кораблям, объект признается опасным существом, и в 1867 году США снаряжают фрегат «Авраам Линкольн» с задачей найти и уничтожить его. На борту находится известный профессор Аронакс со своим слугой Конселем, а также гарпунёр Нед Ленд. В Тихом океане экспедиция сталкивается с таинственным существом, и в результате крушения Аронакс, Консель и Ленд оказываются за бортом. Их спасает не кто иной, как хозяин того самого «монстра» — капитан Немо, командир уникальной подводной лодки «Наутилус». Немо, разорвавший все связи с миром людей, объявляет, что спасенные теперь пленники на борту его корабля, обреченные путешествовать по бескрайним океанам и открывать их тайны, пока Нед Ленд мечтает о побеге.