La historia comienza con Shanti Andía, un niño que asiste al funeral de su tío Juan de Aguirre. Una criada le confía en secreto que el ataúd está vacío y que su tío, lejos de estar muerto, fue en realidad un pirata. Esta revelación enciende la imaginación de Shanti, convirtiendo a su tío en una figura enigmática y fascinante. Años después, ya en su vejez, Shanti se dedica a recopilar los fragmentos de su diario personal. A través de sus escritos, rememora su infancia en el País Vasco, su juventud en Andalucía y sus innumerables aventuras y desventuras como capitán de fragata. Pero sobre todo, el diario documenta su persistente búsqueda, ya como adulto, para desvelar la verdad detrás de la misteriosa 'muerte' de su tío Juan, y si realmente el legendario pirata sigue vivo.