Wyspa skarbów to opowieść o młodym Jimie Hawkinsie, który mieszka z rodzicami w gospodzie "Admiral Benbow" w osiemnastowiecznej nadmorskiej wiosce w Anglii. Spokój ich życia zostaje zakłócony przez pojawienie się tajemniczego marynarza Billy'ego Bonesa, noszącego ze sobą mroczne sekrety z pirackiej przeszłości. Po dramatycznej śmierci Bonesa, Jim odnajduje w jego skrzyni starą mapę wskazującą miejsce ukrycia legendarnego skarbu osławionego kapitana Flinta. Wraz z doktorem Liveseyem i szlachcicem Trelawneyem, Jim wyrusza na szkunerze Hispaniola w ekspedycję. Wkrótce jednak okazuje się, że pozornie życzliwy kucharz Long John Silver, a także część załogi, ma własne, zdradzieckie plany: przejęcie skarbu dla siebie i wzniecenie buntu.